Его Святейшеству сослужили архиепископ Саранский и Мордовский Варсонофий, исполняющий обязанности управляющего делами Московской Патриархии; епископы Балтийский Серафим, викарий Калининградской епархии; Гатчинский Амвросий, викарий Санкт-Петербургской епархии, ректор Санкт-Петербургских духовных школ; Петергофский Маркелл, викарий Санкт-Петербургской епархии; Солнечногорский Сергий, викарий Патриарха Московского и всея Руси, руководитель административного секретариата Московской Патриархии; епископ Выборгский Назарий, викарий Санкт-Петербургской епархии, наместник Александро-Невской лавры.
На богослужении присутствовали заместитель председателя Государственной Думы Федерального Собрания Российской Федерации А.Н. Чилингаров, губернатор Санкт-Петербурга В.И. Матвиенко, вице-губернатор Санкт-Петербурга и руководитель администрации губернатора Санкт-Петербурга В.И. Вахмистров, члены правительства Санкт-Петербурга, руководители ряда крупных музеев.
После чтения Евангелия Святейший Патриарх Кирилл произнес проповедь, посвященную подвигу святых апостолов Петра и Павла.
По завершении Божественной литургии был совершен молебен славным и всехвальным первоверховным апостолам.
По благословению митрополита Санкт-Петербургского и Ладожского Владимира, который не смог участвовать в богослужении по состоянию здоровья, Его Святейшество поздравил с праздником епископ Гатчинский Амвросий. «Впервые в истории Санкт-Петербурга на этом месте, под сводами этого величественного собора, Божественная литургия совершена Святейшим Патриархом Московским и всея Руси», — отметил в приветственном слове владыка Амвросий. В дар Предстоятелю владыка Амвросий преподнес образ святых апостолов Петра и Павла.
Святейший Патриарх Кирилл обратился к пастве с Первосвятительским словом, в котором, в частности, сказал:
«С особым чувством я совершил Божественную литургию в этом историческом кафедральном соборе города на Неве, города святого апостола Петра. История так распорядилась, что многие люди забыли о том, что самый высокий храм в городе, находящийся в самом красивом его месте, является его кафедральным собором. Но пора вспоминать о том, что город носит имя святого Петра, что кафедральный собор находится в Петропавловской крепости, потому что, вспоминая наши символы — духовные, исторические, — мы соединяем времена, мы становимся сильнее, в нас пробуждается национальное самосознание, а вместе с ним и любовь к Родине, любовь к своему родному городу.
Мы иногда задаем себе вопрос, почему люди с таким небрежением относятся к окружающей среде, почему мы с легкостью загрязняем улицы и самые красивые места — и в городах, и вокруг них; почему мы часто не щадим своих памятников. Да потому, что со всем этим не связано сознание человека, его национальное самочувствие, его национальное самопонимание.
Сегодня одна из задач Церкви заключается в том, чтобы возродить все это. Тогда у нас не будет грязи в подъездах, на улицах, у нас города будут чистые, люди с любовью и уважением будут относиться к своей истории, ко всему тому, что было сделано до них, и будут бережно созидать будущее. Не во имя сиюминутных интересов, связанных с наживой, со стремлением жить богаче и лучше, а ответственно созидать будущее, с любовью относясь ко всему тому, что Бог нам вручил и что окружает нас».
Предстоятель Русской Церкви передал в дар Петропавловскому собору в память о первой Патриаршей Божественной литургии Казанскую икону Божией Матери. Все участники исторического богослужения получили образки святых апостолов с памятной надписью.
Затем на площади перед собором состоялось общение Святейшего Патриарха Кирилла с петербуржцами и гостями города.