Μετά το πέρας της Λειτουργίας και του επίσημου γεύματος στο παρεκκλήσιο του Αγίου Βλαδιμήρου του Καθεδρικού Ναού άρχισαν οι εργασίες της Συνόδου προεδρεύοντος του Μητροπολίτη Κορνήλιου. Παρέστησαν κληρικοί της Εσθονικής Ορθόδοξης Εκκλησίας του Πατριαρχείου Μόσχας και ένας λαϊκός από εκάστοτε ενορία.
Την κύρια εισήγηση παρουσίασε ο Μητροπολίτης Ταλλίνης και πάσης Εσθονίας Κορνήλιος, ο οποίος ενημέρωσε τους παρόντες για τα αποτελέσματα του παρελθόντος έτους 2011 και τόνισε το σπουδαιότερο γεγονός της χρονιάς το οποίο ήταν η δημιουργία μιας νέας Επισκοπής Νάρβας και Πριτσούντγιε της Ορθόδοξης Εκκλησίας της Εσθονίας του Πατριαρχείου Μόσχας.
Δεύτερο θέμα της ημερήσιας διάταξης ήταν η υιοθέτηση νέου Καταστατικού. Εξαιτίας δημιουργίας νέας επαρχίες καθώς και άλλες αλλαγές, οφειλούμενες στη σύγχρονη πραγματικότητα, προέκυψε η ανάγκη ουσιαστικών τροποποιήσεων και συμπληρώσεων του παλαιότερου Καταστατικού της Εσθονικής Ορθόδοξης Εκκλησίας του Πατριαρχείου Μόσχας. Για την εργασία επί του κειμένου του Καταστατικού τους παρευρισκομένους πληροφόρησε ο νομικός Σέργιος Τσούρκιν. Το κείμενο υιοθετήθηκε και εν συνεχεία θα παραπεμθεί για την έγκριση του Αγιωτάτου Πατριάρχη Μόσχας και Πασών των Ρωσιών Κυρίλλου.
Το επόμενο θέμα ήταν η εκλογή μελών της Συνόδου, η οποία γίνεται ανά τρια χρόνια. Όλοι οι Ιεράρχες της Εσθονικής Ορθόδοξης Εκκλησίας του Πατριαρχείο Μόσχας είναι θέσει μέλη της Συνόδου. Κατόπιν ψηφοφορίας εξελέγησαν νέα μέλη της Συνόδου: τέσσερις ιερείς και δυο λαϊκοί.
Ακολούθως παρουσιάσθηκαν εισηγήσεις επί των θεμάτων θρησκευτικής παιδείας και κατήχησης, κοινωνικού έργου και εκδόσεων. Ενεκρίθη ο οικονομικός απολογισμός του έτους 2011 και ο προϋπολογισμός του έτους 2012. Τέλος, οι ομιλιτές απάντησαν σε ερωτήσεις των συνέδρων.