Русский православный храм в честь святого Александра Невского построен на участке земли, завещанной Московской Патриархии эмигранткой Сусанной Ивановной Кривцовой с условием поставить там храм после исчезновения советской власти.
Как сообщил в интервью РИА «Новости» настоятель православного подворья Московского Патриархата в Японии отец Николай (Коцюбан), стоимость всего проекта составила около 120 миллионов йен (около 1 миллиона долларов США). Часть необходимых средств была выделена Московским Патриархатом, а часть собрана российскими верующими.
«С Божией и вашей помощью мы завершили строительство в установленные сроки», - сказал отец Николай.
По традиции Русской Православной Церкви, в основании храма установлен каменный короб, куда поместили капсулу из нержавеющей стали со вложенной в нее грамотой, где будет сказано, кем и когда построен храм. Все его внутреннее убранство, в том числе иконостас и иконы, привезено из России, а некоторые предметы - из Александро-Невской Лавры".
Япония официально открылась для христианства лишь с 1870-х годов, и туда немедленно хлынула волна католических и протестантских священников. Русское Православие ответило посылкой всего одного миссионера, однако им оказался человек истинной веры, которая, как сказано, «может двигать горами», - отец Николай, в миру Иван Дмитриевич Касаткин. Его стараниями в Токио был построен православный собор Воскресения Христова, получивший в народе название «Никорай-до» (собор Николая). Помимо роли духовного центра, он стал также важным историческим и культурным памятником, символом духовных связей Японии и России.
В Японии (в организационном плане) существует как российское, так и японское Православие. Параллельно с «Никорай-до» действует православное подворье Московского Патриархата, не имевшее права миссионерской деятельности. С послевоенного времени на подворье приходили русские эмигранты из Харбина и те, кто переместился в Японию сразу после революции, а до недавнего времени ходили верующие из российского, греческого и некоторых других посольств. С возникновением русского православного храма св. Александра Невского деятельность подворья перешла на новый качественный уровень.