Кодекс был написан в IV в. и находился до середины XIX в. на Синайском полуострове — в библиотеке православного монастыря святой Екатерины.
В 1844 году немецкий ученый обнаружил на Синае около сотни пергаментных страниц древнего
греческого Евангельского кодекса (Codex Friderico-Augüstanus), который
оказался впоследствии частью «Синайского кодекса». В 1853 году
Тишендорф предпринял очередное путешествие на Синай и попытался
приобрести оставшиеся части Кодекса, но получил отказ. Тогда он
обратился за помощью к Российскому правительству и приехал в монастырь
святой Екатерины уже как представитель Российского Императора
Александра II, покровительствовавшего обители.
В итоге Тишендорф нашел почти полный текст Кодекса и в 1859 г. привез в
Петербург рукопись, впоследствии получившую название «Синайский
кодекс». Она считается ныне древнейшей унциальной пергаментной рукописью Библии.
Тишендорф получил от Российского Императора потомственное дворянство, а бесценный свиток был передан Императором Александром II в Публичную библиотеку в Петербурге. Через три года Кодекс был издан к 1000-летию Российского государства.
В советские времена эта величайшая христианская реликвия была продана за 100 тысяч фунтов стерлингов Британскому музею в Лондон. С 1973 г. она хранится в Британской библиотеке.
В настоящее время 43 первых листа рукописи, приобретенных в 1844 г. Тишендорфом, хранятся в Лейпциге, 347 листов — в Лондоне, фрагменты от трех листов — в Санкт-Петербурге. Кроме того, обнаруженные в 1975 г. 12 недостающих листов Кодекса, а также 14 фрагментов от других его листов хранятся ныне в монастыре св. Екатерины на Синае.
Все вышеперечисленные владельцы листов и фрагментов Кодекса договорились, что после сканирования всего текста «Синайский кодекс» разместят в Интернете. Первые материалы уже появились в 2008 г., а в июле 2009 г. планируется завершить всю работу.