В рамках конференции прошло несколько круглых столов, на которых выступили священнослужители разных конфессий, а также ученые из России, Польши и Финляндии.

В продолжение конференции состоялись три круглых стола: "Взаимодействие религиозных организаций и государственных органов в реализации основных прав человека: европейский опыт" (председатель - профессор Ян Гросфельд), "Права верующего в контексте прав человека в современном мире" (председатель - священник Сергий Звонарев, сотрудник секретариата ОВЦС МП) и "Ислам и христианство: проблемы взаимоотношений" (председатель - Мухаммед Хенни). Кроме того,  участникам конференции была представлена фотовыставка «Косово: взгляд изнутри».

Основным лейтмотивом конференции был вопрос о сочетаемости религии и понятия «права человека». По убеждению большинства докладчиков, основы концепции прав человека исходно заключены в традиционных религиях - в христианстве и исламе. "Однако современный мир, разрабатывая собственную концепцию прав человека, прибегает к двойным стандартам", - считает один из организаторов конференции, ведущий аналитик Санкт-Петербургского центра изучения современного Ближнего Востока, кандидат исторических наук Александр Сотниченко.

Примечательно, что на конференции была проведена специальная секция, посвященная проблеме взаимоотношений между христианством и исламом. С докладами на ней выступили известные исламоведы Мухаммед Хенни, Исраэль Шамир, главный редактор Санкт-Петербургского центра изучения современного Ближнего Востока Гумер Исаев и другие ученые. Участники дискуссии попытались развенчать миф о несовместимости ислама и христианства. В заключение работы секции Мухаммед Хенни предложил в перспективе провести в Петербурге конференцию, посвященную религиозной жизни современного Иерусалима.