Одновременно с ремонтно-строительными работами, которые проводил ВАКФ с 1938 по 1942 год, Гамильтон проводил раскопки под опорами мечети, и его работа со всеми документами была опубликована под названием «Структурная история Аль-Аксы».
Гамильтон обнаружил византийский мозаичный пол, а под ним микву (водный резервуар для омовения) периода Второго Храма, хотя последнюю находку он не стал включать в работу о мечети. Однако, фотография в деле имеется, сказал археолог Цахи Цвайг.
Цахи Цвайг обнаружил фотографии в Британских археологических архивах израильского Управления древностями.
Византийский мозаичный пол, обнаруженный под уровнем Омейядов в мечети, «несомненно», является остатком общественного здания – возможно, церкви – которое предшествовало мечети, сказал Цвайг на археологической конференции в Бар-Иланском университете. Такую же мозаику можно обнаружить в церкви Рождества в Бейт-Лехеме.
«Существование общественного здания в византийский период на Храмовой горе весьма неожиданно в свете того факта, что исторические тексты ничего об этом не сообщают», – сказал Цвайг.
В последние несколько лет археологами Цахи Цвайгом и Габи Баркаи среди обломков и строительного мусора, который ВАКФ вывозил с Храмовой горы, были найдены многочисленные мраморные обломки церковного алтаря.
Мозаичный пол на Храмовой горе датируется 5–7 веком новой эры, сказала доктор Рина Тальгман из Еврейского университета. «Мы были очень удивлены, обнаружив такую мозаику на Храмовой горе», – сказала Тальгман. Это противоречит рассказам паломников, которые утверждали, что в византийский период Храмовая гора была заброшенным местом. Но эта мозаика вряд ли могла относиться к ранне-исламскому периоду, так как первая мечеть на этом месте была построена из дерева.
«Простой мозаичный рисунок не дает нам никакого намека на то, что это строение было церковью, но это строение могло быть частью гостиницы или какого-то другого строения», – сказала Тальгман.
После завершения Британского мандата в 1948 году и освобождения Иерусалима в 1967 году никаких раскопок на Храмовой горе не проводилось. С 1948 по 1967 год эта территория находилась под иорданской оккупацией, а правительство Израиля отказалось от проведения раскопок, чтобы не задеть религиозные чувства арабов и евреев.
«Трудно с точностью определить, что на этом месте и вправду была церковь. Но, несомненно, это было здание общественного назначения, вполне вероятно, церковь или монастырь», – сказал доктор Габи Баркаи. Он назвал архивную находку «важной» и «сенсационной». «Это меняет всю историю Храмовой горы в византийский период», – сказал он.