Журнал «Вопросы теологии» издается с 2019 г. Периодичность выпусков журнала — четыре номера в год (ежеквартально).

Журнал учрежден Религиозной организацией — духовная образовательная организация высшего образования Русской Православной Церкви «Общецерковная аспирантура и докторантура им. святых равноапостольных Кирилла и Мефодия» и Санкт-Петербургским государственным университетом.