Впервые после падения Берлинской стены произошло объединение церквей Востока и Запада. Церковь Северной Германии, число прихожан которой составит 2.3 млн человек, с границами от Дании до Польши, станет одной из крупнейших среди 20 региональных протестантских церквей страны.
За последние несколько лет произошли две реорганизации структуры Евангелическо-лютеранской Церкви Германии. 1 января 2009 г. объединились протестантские церкви Тюрингии и церковной провинции Саксония в одну Евангелическую церковь Центральной Германии. Число прихожан новой церковной общины составило около 900 тыс. человек. 1 января 2004 г. церкви земель Берлин-Бранденбург и Силезская Верхняя Лужица объединились в Евангелическую церковь Берлина-Бранденбурга-Силезской Верхней Лужицы, количество прихожан которой в настоящее время составляет около 1.1 млн.