После ликвидации в июне 1930 года округов Пермский окружной архив преобразовали в городской архив, а 10 октября 1930 г. — в Пермское отделение Свердловского областного архива.
При образовании в октябре 1938 года Пермской области архив был реорганизован в два самостоятельных учреждения — исторический архив и архив Октябрьской революции. Они вошли в ведение Пермского областного архивного управления, подчинявшегося Главному архивному управлению НКВД СССР. В ноябре 1940 года архивы были объединены в государственный архив Молотовской области (ГАМО) с отделами дореволюционных и секретных фондов, фондов Октябрьской революции и социалистического строительства, научно-справочной литературы и читальным залом. В 1943 году к ним добавился отдел использования архивных документов.
В январе 1960 года Главное архивное управление МВД СССР, в подчинении которого находился ГАПО (после переименования в 1957 году Молотовской области в Пермскую), было преобразовано в Главное архивное управление при Совете Министров СССР.
В 1966 году ГАПО переехал в новое, специально для него построенное здание. С этого момента началось планомерное комплектование архива документами учреждений, организаций, предприятий, частных лиц.
Указом губернатора Пермской области от 15 августа 2002 года Государственный архив Пермской области преобразован в государственное областное учреждение «Государственный архив Пермской области».
В связи с образованием Пермского края на основании Федерального конституционного закона от 25 марта 2004 г. «Об образовании в составе Российской Федерации нового субъекта Российской Федерации в результате объединения Пермской области и Коми-Пермяцкого автономного округа», архив получил статус государственного краевого учреждения. Учредителем является Правительство Пермского края в лице Агентства по делам архивов Пермского края. Устав государственного краевого учреждения «Государственный архив Пермского края» утвержден приказом Агентства от 4 сентября 2008 г.
Приказом по архиву от 14.09.2011 г. № 92 Наименование Государственное краевое учреждение «Государственный архив Пермского края» изменено на Государственное краевое бюджетное учреждение «Государственный архив Пермского края».