Магистратура осуществляет подготовку специалистов в области истории церковного искусства (архитектура, живопись, пластика). Программа ориентирована на углублённое изучение истории византийского и древнерусского искусства и иконографии, а также искусства восточно-христианских церквей и современного православного церковного искусства. Кроме дисциплин по истории церковного искусства, философии и иностранного языка, студенты изучают богословие иконы, церковную археологию и литургику, овладевают методом описания и анализа памятников искусства, знакомятся с современными методами и подходами в изучении церковного искусства и теорией искусства, а также изучают принципы хранения, консервации и реставрации памятников. Особенностью образовательного подхода магистратуры МДА является подготовка студентов к самостоятельной работе с источниками по истории восточно-христианского искусства, основанная на знании древнегреческого языка, истории Византии, византийской и древнерусской литературы, изучению которых придаётся особое значение.
Дисциплины магистерской программы « История искусства восточно-христианской Церкви» дают возможность студенту глубже специализироваться в выбранной им области истории и теории христианского искусства:
1. Современные философские течения
2. Современные информационные технологии (по специализации «История церковного искусства»)
3. Современный иностранный язык (на базе специальной литературы / источников)
4. Методика преподавания
5. Актуальные проблемы изучения византийского искусства
6. Актуальные проблемы изучения искусства средневековой Руси
7. Искусство восточно-христианской Церкви XV-XIX вв.
8. Современное православное церковное искусство
9. Актуальные проблемы восточно-христианской иконографии
10. Описание и анализ памятников церковного искусства
11. Теория и методология истории церковного искусства
12. Иконоведение (богословие иконы православной Церкви)
13. Церковная археология (археология Святой Земли, Византии и Древней Руси)
14. Историческая литургика
15. Актуальные проблемы истории Византии
16. История византийской литературы
17. История древнерусской литературы
18. Древнегреческий язык
19. Хранение и реставрация произведений церковного искусства
20. Проблемы музеефикации произведений церковного искусства.